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科研快訊 | 新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的研究進(jìn)展(八)


1.2019-nCoV 疫情快訊 

2020年2月7日

▄ 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)針對(duì)新型冠狀病毒肺炎疫情研究攻關(guān)情況舉行了新聞發(fā)布會(huì)。據(jù)發(fā)布會(huì)現(xiàn)場(chǎng)介紹,來(lái)自華南農(nóng)業(yè)大學(xué)等單位的研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)聯(lián)合攻關(guān),在新型冠狀病毒潛在中間宿主的溯源上取得突破。他們的最新研究表明,穿山甲可能為新型冠狀病毒的中間宿主。據(jù)了解,攻關(guān)團(tuán)隊(duì)通過(guò)分析1000多份宏基因組樣品,鎖定穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主;繼而通過(guò)分子生物學(xué)檢測(cè),揭示穿山甲中β冠狀病毒的陽(yáng)性率為70%;進(jìn)一步對(duì)病毒進(jìn)行分離鑒定,電鏡下觀察到典型的冠狀病毒顆粒結(jié)構(gòu);最后通過(guò)對(duì)病毒的基因組分析,發(fā)現(xiàn)分離的病毒株與目前感染人的毒株序列相似度高達(dá)99%。以上結(jié)果表明,穿山甲可能是新型冠狀病毒的中間宿主。研究結(jié)果對(duì)本次疫情的源頭防控具有重大意義,為野生動(dòng)物管控的相關(guān)政策調(diào)整提供了科學(xué)依據(jù)。

2020年2月5日

▄每日可檢測(cè)萬(wàn)人份樣本的新型冠狀病毒應(yīng)急檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室—“火眼”實(shí)驗(yàn)室在武漢正式啟動(dòng)試運(yùn)行?!盎鹧邸睂?shí)驗(yàn)室由武漢市政府、東湖高新區(qū)、中交二航局、上海諾瑞實(shí)驗(yàn)室、華大基因聯(lián)合共建。1月30日,華大基因完成實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì),中交二航局于1月31日正式啟動(dòng)實(shí)驗(yàn)室施工,在中交二航局和上海諾瑞的279名員工全力奮戰(zhàn)下,僅用5天時(shí)間,完成實(shí)驗(yàn)室主體施工。核心實(shí)驗(yàn)區(qū)總面積達(dá)1000平米,嚴(yán)格按照P2(生物安全二級(jí))實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì),裝備華大智造高通量測(cè)序整體解決方案和設(shè)備;配置30臺(tái)B2級(jí)生物安全柜;批量自動(dòng)化核酸提取平臺(tái)配置12臺(tái)自動(dòng)化提取設(shè)備;同時(shí),配備有配套實(shí)驗(yàn)室隔間、樣本間、試劑保存間、辦公區(qū)等,新型冠狀病毒核酸檢測(cè)日通量可達(dá)萬(wàn)人。

世界衛(wèi)生組織在總部日內(nèi)瓦召開(kāi)了新聞發(fā)布會(huì),宣布國(guó)際社會(huì)啟動(dòng)了一項(xiàng)新冠病毒戰(zhàn)略準(zhǔn)備和響應(yīng)計(jì)劃(strategic preparedness and response plan,SPRP)。這一戰(zhàn)略計(jì)劃需要6.75億美元的投資,覆蓋2020年2月到4月,主要目的是防止新冠病毒在中國(guó)和世界上的進(jìn)一步擴(kuò)散,并且保護(hù)醫(yī)療健康系統(tǒng)較弱的國(guó)家和地區(qū)。

▄ 來(lái)自武漢大學(xué)等單位的研究團(tuán)隊(duì)在Military Medical Research(軍事醫(yī)學(xué)研究)發(fā)表 A rapid advice guideline for the diagnosis and treatment of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) infected pneumonia (Standard version)(《新型冠狀病毒(2019-nCoV)感染的肺炎診療快速建議指南(標(biāo)準(zhǔn)版)》)。該指南遵照WHO快速建議指南方法學(xué)、融合臨床一線診治經(jīng)驗(yàn),圍繞2019-nCoV的病因、防控、診斷、治療和護(hù)理展開(kāi)[1]。

2. 2019-nCoV生物學(xué)研究進(jìn)展

2020年2月4日

▄復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院肝癌研究所藍(lán)斐,蔡加彬等人在bioRxiv在線發(fā)表研究論文。論文指出,相當(dāng)比例的SARS和2019-nCoV患者除了呼吸系統(tǒng)外,還會(huì)出現(xiàn)不同程度的肝損傷,其機(jī)制和意義尚未確定。而該研究使用兩個(gè)獨(dú)立隊(duì)列的單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)對(duì)健康肝臟組織中ACE2的細(xì)胞類型特異性表達(dá)進(jìn)行了評(píng)估,并鑒定了膽管細(xì)胞中的特異性表達(dá)新冠病毒受體ACE2,而肝細(xì)胞則表達(dá)很低。結(jié)果表明,新冠病毒患者出現(xiàn)的肝損傷,可能是病毒直接與ACE2陽(yáng)性膽管細(xì)胞結(jié)合導(dǎo)致膽管功能障礙,或是治療藥物引起的毒副作用,而不是病毒直接與肝細(xì)胞結(jié)合引起。這些結(jié)果提示了正在救治新冠病毒感染患者的醫(yī)療工作者,需要注意患者的肝反應(yīng),尤其是與膽管細(xì)胞功能有關(guān)的肝反應(yīng),需要對(duì)出現(xiàn)肝功能異常的新冠肺炎患者進(jìn)行特別護(hù)理[2]。

3.2019-nCoV治療藥物研究進(jìn)展

2020年2月4日

▄來(lái)自德國(guó)美因茲大學(xué)的研究者在著名國(guó)際醫(yī)學(xué)期刊《柳葉刀》的一篇報(bào)道稱,為了降低新冠病毒感染死亡率,宿主導(dǎo)向療法應(yīng)為一種選擇。針對(duì)2019-nCoV,現(xiàn)在還沒(méi)有特異性抗病毒療法。目前臨床治療的主要方法是對(duì)癥治療,以及對(duì)重癥患者重癥監(jiān)護(hù)的器官支持治療。WHO和其他全球公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)開(kāi)展的空前活動(dòng)主要集中在預(yù)防病毒傳播、感染控制措施和篩查旅客等方面。疫苗研發(fā)已經(jīng)獲得快速資金支持,然而,就像SARS-CoV和MERS-CoV一樣,降低2019-nCoV死亡率的治療研發(fā)資金目前尚未到位。而該領(lǐng)域迫切需要集中經(jīng)費(fèi)和科學(xué)投入,推進(jìn)針對(duì)冠狀病毒感染的新型治療干預(yù)措施。隨著2019-nCoV繼續(xù)傳播和進(jìn)化,死亡人數(shù)正在呈指數(shù)級(jí)增長(zhǎng),推進(jìn)新的治療研發(fā)對(duì)于最大限度降低2019-nCoV感染死亡人數(shù)至關(guān)重要。

( 請(qǐng)參考:https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30305-6)

▄ 英國(guó)倫敦帝國(guó)學(xué)院Justin Stebbing團(tuán)隊(duì)在國(guó)際頂級(jí)醫(yī)學(xué)期刊《柳葉刀》在線發(fā)表研究論文。該研究基于大型醫(yī)療信息存儲(chǔ)庫(kù)BenevolentAI的知識(shí)圖譜,利用機(jī)器學(xué)習(xí)進(jìn)行搜索,發(fā)現(xiàn)巴瑞替尼(Baricitinib),可能具有降低病毒感染肺細(xì)胞的能力[3]。(巴瑞替尼,CAS號(hào)為1187594-09-7,是一種JAK1/2酪氨酸激酶抑制劑,其在中國(guó)的上市申請(qǐng)(JXHS1800009)獲得國(guó)家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)批準(zhǔn),用于治療對(duì)甲氨蝶呤響應(yīng)不足的中重度類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎。)

圖1. BenevolentAI知識(shí)圖以及Baricitinib的結(jié)構(gòu)式。BenevolentAI知識(shí)圖集成了來(lái)自結(jié)構(gòu)化和非結(jié)構(gòu)化來(lái)源的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)。它用一列算法來(lái)發(fā)現(xiàn)新的作用關(guān)系,以提出應(yīng)對(duì)疾病的新方法。2019-nCoV代表2019新型冠狀病毒;AAK1 代表 AP-2相關(guān)激酶1;GAK代表細(xì)胞周期蛋白g相關(guān)激酶;JAK1/2代表janus激酶1/2。

▄ 中科院武漢病毒所肖庚富,胡志紅及軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院毒物藥物研究所鐘武共同通訊在Cell Research在線發(fā)表研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)氯喹,在細(xì)胞水平上能有效抑制2019-nCoV的感染,不過(guò)其在人體上的作用還有待臨床驗(yàn)證。(氯喹,CAS號(hào)54-05-7,通過(guò)增加病毒/細(xì)胞融合所需的內(nèi)體pH來(lái)阻斷病毒感染;最初用來(lái)治療瘧疾,以后用途逐漸擴(kuò)大。1951年,用于治療氯喹類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎,有一定效果)氯喹及巴瑞替尼都是抑制病毒進(jìn)入細(xì)胞過(guò)程,這兩項(xiàng)研究有相似之處[4]。

2020年2月5日

▄中日友好醫(yī)院王辰、曹彬團(tuán)隊(duì)在武漢市金銀潭醫(yī)院宣布啟動(dòng)瑞德西韋(remdesivir)治療2019新型冠狀病毒感染研究,正式開(kāi)始進(jìn)入臨床試驗(yàn)。入組患者761例,其中入組輕、中癥患者308例,重癥患者453例采取隨機(jī)雙盲的方式進(jìn)行藥物測(cè)試。吉利德公司的瑞德西韋在澳大利亞完成證明該藥物可抑制埃博拉病毒的擴(kuò)散和復(fù)制的二期臨床試驗(yàn),證實(shí)了對(duì)非典型性肺炎(SARS)和中東呼吸綜合征(MERS)的病毒病原體均有活性。這些病毒均屬于冠狀病毒,且與2019-nCoV新型冠狀病毒的結(jié)構(gòu)相似。值得提及的是由于美國(guó)新冠肺炎患者服用該藥后,效果顯著;國(guó)內(nèi)即刻引進(jìn),直接跳過(guò)一期與二期臨床試驗(yàn),進(jìn)入3期臨床研究。Remdesivir三期臨床試驗(yàn)計(jì)劃顯示,2月5日正式開(kāi)始試驗(yàn),初步完成將在2020年4月10日,預(yù)計(jì)最終完成將在4月27日。

4. 2019-nCoV流行病學(xué)統(tǒng)計(jì)

2020年2月5日

▄ 杭州市新增新型冠狀病毒感染的肺炎確診病例10例,其中有1對(duì)夫妻(丈夫徐某某、妻子王某某)同時(shí)被確診,目前在定點(diǎn)醫(yī)療機(jī)構(gòu)隔離治療。經(jīng)流行病學(xué)調(diào)查,杭州確診夫妻與確診病例近距離相遇50秒,沒(méi)戴口罩,即被傳染。另一起發(fā)在寧波的快速感染事件,也是因?yàn)楸桓腥菊呶创骺谡?。該名患者在雙東坊菜場(chǎng)買(mǎi)菜時(shí)與路人(江北區(qū)確診患者:女,61歲)在同一攤位有過(guò)短暫(約15秒)的近距離,且兩人均未佩戴口罩,而后該名患者被傳染。

2020年2月4日

▄ 國(guó)家衛(wèi)健委在北京舉行新聞發(fā)布會(huì)。據(jù)介紹,死亡患者主要是集中在湖北省,截止到2月3日24時(shí)累計(jì)414人,占全國(guó)的97%,湖北省確診病例的病死為3.1%,全國(guó)為2.1%。

▄據(jù)國(guó)家衛(wèi)生健康委醫(yī)政醫(yī)管局副局長(zhǎng)焦雅輝說(shuō)明:“武漢市的死亡人數(shù)是313人,占全國(guó)死亡的74%,武漢市的病死率是4.9%。湖北省和武漢市的病死率都是高于全國(guó)水平的,如果除掉湖北省以外的其他省份的病死率是0.16%。所以,從這組數(shù)字大家可以看出,主要的死亡還是在湖北,主要還是集中在武漢,對(duì)于全國(guó)其他省份,雖然病例數(shù)也不少,但是病死率其實(shí)是相當(dāng)?shù)偷?。從這一點(diǎn)來(lái)講,我們還是有信心的,我們這些病例絕大多數(shù)還是輕型的病例,所以不必產(chǎn)生恐慌。

▄從對(duì)死亡病例的分析情況來(lái)看,我們也測(cè)算了一下,全國(guó)的病死率基本是穩(wěn)定的,現(xiàn)在是2.1%,疫情初期時(shí)是2.3%,可以說(shuō)是略有下降。對(duì)死亡病例進(jìn)行分析,以男性為主,占2/3,女性占1/3,并且是高齡為主,80%以上都是60歲以上的老年人,75%以上是一有種或一種以上的基礎(chǔ)疾病,并且這些基礎(chǔ)疾病都是心腦血管疾病,糖尿病,還有一些患者是有腫瘤這樣的基礎(chǔ)疾病。我想跟大家解釋一點(diǎn),對(duì)于高齡而且有基礎(chǔ)疾病的老年人,只要感染了肺炎,不是指這次新型冠狀病毒感染的肺炎,這些高齡的有基礎(chǔ)疾病的老年人,只要感染了肺炎,在臨床上來(lái)講就是一種高危因素,病死率本身也是很高的,所以并不是說(shuō)因?yàn)楦腥玖诉@次新型冠狀病毒感染的肺炎病死率才高”。

參考文獻(xiàn):

[1] Jin Y-H, Cai L, Cheng Z-S, et al. A rapid advice guideline for the diagnosis and treatment of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)infected pneumonia (standard version). Military Medical Research 2020;7:4.

[2]Chai X, Hu L, Zhang Y, et al. Specific ACE2 Expression in Cholangiocytes May Cause Liver Damage After 2019-nCoV Infection. bioRxiv 2020:2020.02.03.931766.

[3]Richardson P,GriffinI,TuckerC,etal.Baricitinib as potential treatment for 2019-nCoV acute respiratory disease. The Lancet 2020.

[4]Wang M, Cao R,Zhang L,etal. Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in vitro. Cell Res 2020.

 

供稿 | 坪山生物醫(yī)藥研發(fā)轉(zhuǎn)化中心、科研部

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