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05
2020
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03
科研快訊 | 新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）的研究進展（三十四）
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COVID-19疫情快訊
■3月4日，國家衛(wèi)生健康委、國家中醫(yī)藥管理局組織專家在對前期醫(yī)療救治工作進行分析研判總結的基礎上，對診療方案進行再次修訂，形成了《新冠肺炎診療方案（試行第七版）》。這次修訂增加了病理改變內容，對臨床表現、診斷標準、治療方法和出院標準等也進行了增補和調整，將有利于根據不同人群的疾病特點，更加精準的開展診療和救治。其中，傳播途徑方面增加“由于在糞便及尿中可分離到新型冠狀病毒，應注意糞便及尿對環(huán)境污染造成氣溶膠或接觸傳播”。另外，鑒于有少數出院患者出現核酸檢測復檢陽性的問題，為加強對出院患者的健康管理和隔離，此次修訂將“應繼續(xù)進行14天自我健康狀況監(jiān)測”改為“應繼續(xù)進行14天的隔離管理和健康狀況監(jiān)測”，同時要求佩戴口罩，有條件的居住在通風良好的單人房間，減少與家人的近距離密切接觸，分餐飲食，做好手衛(wèi)生，避免外出活動。
■3月2日，芝加哥大學官網發(fā)布消息稱，由芝加哥大學、阿貢國家實驗室等團隊聯(lián)合研究，在2019-nCoV蛋白中發(fā)現了COVID-19新的潛在的藥物靶點。該靶點Nsp15蛋白與SARS爆發(fā)時期的蛋白有89%的氨基酸序列同源性，而關于SARS病毒的研究表明,抑制該靶點可以減緩病毒的復制，這意味著針對Nsp15的藥物可以作為治療COVID-19的潛在藥物。新定位的蛋白Nsp15，在冠狀病毒中具有保守性，在它們的生命周期和毒力中都是必不可少的。最初，Nsp15被認為是直接參與病毒復制，但在本次研究中，研究人員發(fā)現，Nsp15通過干擾宿主的免疫反應來幫助病毒復制。Nsp15蛋白在SARS中被作為新藥開發(fā)的新靶點，但并未取得很大進展，因為SARS疫情消失后，所有的新藥研發(fā)都結束了。一些抑制劑雖然在當時已經被鑒定了出來，但從未進一步進行藥物研發(fā)，針對SARS開發(fā)的抑制劑現在可以針對這種蛋白進行測試。另外，Nsp15的結構將于3月4日在RSCB蛋白數據庫上發(fā)布。
（參見：https://news.uchicago.edu/story/new-coronavirus-protein-mapped-chicago-reveals-drug-target）
2. COVID-19生物學研究進展
■3月3日，北京大學生命科學學院生物信息中心陸劍研究員和中國科學院上海巴斯德研究所崔杰研究員在中國科學院主辦的National Science Review上發(fā)表了名為《關于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進化》（On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2）的論文。論文通過對103個新冠病毒全基因組分子進化分析，發(fā)現病毒株已發(fā)生了149個突變點，而且多數是近期產生的。該研究揭示：新冠病毒已經演化出L和S兩個亞型，其中101個屬于這兩個亞型。從占比上看，L亞型更為普遍達到70%，S亞型占30%。論文作者認為，根據新型冠狀病毒的演變方式推測，L亞型和S亞型的傳播能力、致病嚴重程度或許存在較大區(qū)別。通過與其他冠狀病毒比較，作者發(fā)現S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進化樹上更接近，從而得出S型相對更古老的結論。L亞型在武漢爆發(fā)的早期階段更為普遍，而L亞型的發(fā)生頻率在2020年1月初后有所下降。作者認為，人為干預可能對L亞型施加了更大的選擇性壓力，如果沒有這些干預，L亞型可能更具侵略性和擴散得更快速。另一方面，由于選擇壓力相對較弱，在進化上較老且攻擊性較小的S型可能在相對發(fā)生頻率上有所增加。這些發(fā)現意味著，目前迫切需要結合基因組數據、流行病學數據和2019年冠狀病毒病患者臨床癥狀圖表記錄，進行進一步的全面研究。另外，值得注意的是，這103個樣本顯示，大部分患者只感染了L亞型或S亞型中的一個。但其中一位近期有過武漢旅行史的美國患者分離出的病毒株，顯示其可能同時感染了L型和S型新冠病毒。不過，作者表示目前還無法排除新突變型的可能性[1]。
■3月2日，來自中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院等單位的科研人員在預印本平臺bioRxiv上發(fā)表了一篇題為“新冠病毒演化中的突變、重組與插入”（Mutations, Recombination and Insertion in the Evolution of 2019-nCoV）的研究。研究團隊收集并分析了120個新冠病毒基因組序列，其中包括從11名中國患者身上最新采集到的毒株基因組序列。研究構建的系統(tǒng)發(fā)育樹表明，不同毒株之間基因序列的差異非常有限。擁有3萬堿基的新冠病毒，只有幾個堿基發(fā)生了變異。
研究還認為，與新冠病毒同源性最高的蝙蝠RaTG13病毒和穿山甲冠狀病毒之間可能發(fā)生過基因重組。因此，盡管新冠病毒在整體基因結構上與RaTG13最高度同源，但其表面的S蛋白與受體結合的結構域與穿山甲冠狀病毒最一致。而S蛋白中存在的獨特的四個氨基酸插入（PRRA），可能是弗林（Furin）蛋白酶或TMPRSS2（跨膜絲氨酸蛋白酶2）的酶切位點。冠狀病毒在入侵宿主細胞時有可能發(fā)生了蛋白酶裂解，從而觸發(fā)病毒與宿主細胞膜的融合。以上可能解釋新冠病毒的傳染性為何會如此之強[2]。
3. COVID-19流行病學研究
■3月4日，新加坡國家傳染病中心的研究者在國際頂級醫(yī)學期刊JAMA在線發(fā)表題為“Air, Surface Environmental, and Personal Protective Equipment Contamination by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) From a Symptomatic Patient”的研究論文，該研究從新加坡3名患者在空氣傳播隔離室（每小時進行12次空氣交換）、休息室和浴室等26個地點采集了地面環(huán)境樣本。該研究發(fā)現，一名患者的樣本在15個房間（包括排氣扇）中有13個（87％）檢測結果呈陽性，在5個廁所（馬桶、水槽和門把手）中有3個（60％）結果呈陽性。另外，患者的大便樣本檢測呈現陽性。
該研究顯示，一名輕度上呼吸道感染的2019-nCoV患者對環(huán)境造成了廣泛的污染：馬桶和水槽樣本均為陽性，表明糞便中的病毒可能是潛在的傳播途徑。清潔后樣品為陰性，表明目前的清潔措施已足夠。從排氣口抽出的拭子測試呈陽性，表明載有病毒的細小顆?？赡鼙粴饬髦脫Q并沉積在通風口等設備上。2019-nCoV患者通過呼吸道飛沫和排出的糞便對環(huán)境造成污染，表明環(huán)境是潛在的傳播媒介，因此有必要嚴格遵守環(huán)境衛(wèi)生和手部衛(wèi)生[3]。
■3月3日，新加坡國家傳染病中心的研究者們在頂級醫(yī)學期刊JAMA在線發(fā)表題為“Epidemiologic Features and Clinical Course of Patients Infected With SARS-CoV-2 in Singapore”的研究論文，該研究首次介紹了新加坡2019-nCoV感染患者的流行病學特征和臨床過程。該研究發(fā)現，在18例經PCR確診的2019-nCoV感染住院患者（中位年齡為47歲；9名女性）中，臨床表現為上呼吸道感染者12例，6人需要補充氧氣；其中，有2名需要重癥監(jiān)護，沒有死亡。通過PCR在糞便（4/8 [50％]）和血液（1/12 [8％]）中檢測到病毒，但在尿液中未檢測到。5名需要補充氧氣的患者接受了洛匹那韋-利托那韋治療。使用洛匹那韋-利托那韋治療的5例患者中有4例出現惡心、嘔吐和/或腹瀉，而3例出現肝功能異常檢查結果?？偠灾?，在新加坡首批被診斷為2019-nCoV感染的18例患者中，臨床表現通常是輕度呼吸道感染。一些患者需要補充氧氣，并在接受抗逆轉錄病毒藥物治療后有不同的臨床結果[4]。
■3月3日，華中科技大學同濟醫(yī)院，金銀潭醫(yī)院等多單位合作在預印版平臺medRxiv在線發(fā)表未經同行評審的題為“Highly ACE2 Expression in Pancreas May Cause Pancreas Damage After SARS-CoV-2 Infection”的研究論文，該研究發(fā)現ACE2在胰腺（外分泌腺和胰島中）中表達和分布。而且，包括輕度和重度COVID-19患者在內的臨床數據表明存在輕度胰腺炎。67例重癥患者中，有11例(16.41%)出現淀粉酶和脂肪酶水平升高，5例(7.46%)出現影像學改變。只有1例(1.85%)顯示淀粉酶和脂肪酶水平升高，但未見影像學改變?？偠灾撗芯拷沂玖薈OVID-19患者輕度胰腺損傷的現象和可能的原因，這表明2019-nCoV感染后的胰腺炎也應在臨床工作中予以重視[5]。
參考文獻：
[1] Tang X, Wu C, Li X, et al. On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2. National Science Review 2020.
[2] Wu A, Niu P, Wang L, et al. Mutations, Recombination and Insertion in the Evolution of 2019-nCoV. bioRxiv 2020:2020.02.29.971101.
[3] Ong SWX, Tan YK, Chia PY, et al. Air, Surface Environmental, and Personal Protective Equipment Contamination by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) From a Symptomatic Patient. JAMA 2020.
[4] Young BE, Ong SWX, Kalimuddin S, et al. Epidemiologic Features and Clinical Course of Patients Infected With SARS-CoV-2 in Singapore. JAMA 2020.
[5] Liu F, Long X, Zou W, et al. Highly ACE2 Expression in Pancreas May Cause Pancreas Damage After SARS-CoV-2 Infection. medRxiv 2020:2020.02.28.20029181.
供稿 | 坪山生物醫(yī)藥研發(fā)轉化中心、科研部
編輯 | 鮑 啦
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