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2020

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科研快訊 | 新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的研究進(jìn)展(三十九)


1. COVID-19生物學(xué)研究進(jìn)展 

■ 3月12日,國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制舉辦的新聞發(fā)布會上,國家衛(wèi)生健康委新聞發(fā)言人、宣傳司副司長米鋒表示:武漢新增確診病例8例,已經(jīng)降至個位數(shù);湖北除武漢以外,所有地市已連續(xù)1周無新增確診病例;湖北以外省份,新增確診病例7例,其中6例為境外輸入病例。以上信息提示,總體上,我國本輪疫情流行高峰已經(jīng)過去,新增發(fā)病數(shù)在持續(xù)下降,疫情總體保持在較低水平。要把醫(yī)療救治工作擺在第一位,不麻痹、不厭戰(zhàn)、不松勁,毫不放松抓緊各項防控工作。

■ 3月12日,在廣東省疫情防控例行新聞發(fā)布會上,鐘南山院士表示,本次疫情在6月份結(jié)束是可以期待的。一般來說,冠狀病毒在溫度較高的夏天比較不活躍,不過,疫情的結(jié)束時間,也取決于各個國家的重視程度。假如一些國家不重視疫情的危害性和傳染性,結(jié)束的時間就不好說了。此外,對于部分病人復(fù)檢呈陽性的問題,鐘南山表示,在香港的一項研究中,從復(fù)陽患者體內(nèi)檢測到的可能是新型冠狀病毒的殘余核酸片段,沒有查出活病毒。因此基于目前的資料,尚未發(fā)現(xiàn)復(fù)陽病人有傳染性。

2. COVID-19生物學(xué)研究進(jìn)展

■ 3月11日,中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所譚文杰在國際頂級醫(yī)學(xué)期刊JAMA在線發(fā)表題為“Detection of SARS-CoV-2 in Different Types of Clinical Specimens”的研究論文,該研究觀察了新型冠狀病毒在新冠肺炎(COVID-19)住院患者的不同組織之間的生物分布,這些患者是根據(jù)癥狀和放射學(xué)診斷并通過新型冠狀病毒檢測證實的,這項研究得到參與醫(yī)院的倫理委員會的批準(zhǔn)。該研究發(fā)現(xiàn),從205名COVID-19患者的多個部位的標(biāo)本中檢測到新型冠狀病毒,其中下呼吸道樣品最常檢測出該病毒。重要的是,在糞便中檢測到活病毒,這表明新型冠狀病毒可能通過糞便途徑傳播。一小部分血液樣本的PCR檢測結(jié)果呈陽性,這表明感染有時可能是全身性的。病毒通過呼吸道和呼吸道外途徑的傳播可能有助于解釋疾病的迅速傳播[1]。

■ 3月11日,預(yù)印本平臺Preprints上發(fā)表一篇題為“Serological Test is an Efficient Supplement of RNA Detection for Confirmation of SARS-CoV-2 Infection”的論文,研究表明病毒RNA檢測與血清學(xué)檢測相結(jié)合,既能提高診斷的敏感性,又能保持較高的特異性。新型冠狀病毒特異性血清檢測對臨床實踐和公共衛(wèi)生具有重要價值。研究人員采用了化學(xué)發(fā)光法、酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)、膠體金法檢測血清總抗體(Ab)和免疫球蛋白(IgM)抗體。結(jié)果表明,三種方法對總Ab和IgM檢測的敏感性和特異性均較高,與IgM相比,Ab檢測的敏感性更高。研究結(jié)果表明,RNA和Ab試驗的聯(lián)合應(yīng)用可以提高診斷的敏感性,同時保持較高的特異性,這被認(rèn)為對臨床實踐和公共衛(wèi)生具有重要價值??傮w上,ELISA法和化學(xué)發(fā)光法檢測Ab具有取樣方便、高通量、高效、可定量或半定量的特點,膠體金法是一種實時、重點檢測的方法。以上抗體檢測方法應(yīng)作為不同情況下RNA檢測的有效補(bǔ)充,以提高診斷的敏感性和特異性[2]。

■ 3月8日,澳大利亞墨爾本大學(xué)等單位的研究者在預(yù)印本平臺bioRxiv發(fā)表了題為“Direct RNA sequencing and early evolution of SARS-CoV-2”的論文。研究人員提供了新型冠狀病毒的直接RNA序列,介紹了該冠狀病毒亞基因組長度的mRNA結(jié)構(gòu),并描述了從共享數(shù)據(jù)中揭示的冠狀病毒進(jìn)化遺傳學(xué)的信息。該研究使用了一種最近建立的基于高度平行納米孔陣列的直接RNA測序方法,通過這種方法,新型冠狀病毒樣本在40小時的測序中產(chǎn)生了680347個讀數(shù),包含了860Mb的序列信息。與培養(yǎng)的新型冠狀病毒分離株的基因組一致,部分讀數(shù)屬于冠狀病毒序列(28.9%),包括分布在29893個堿基基因組中的367Mb序列。其中一些的長度超過2萬個堿基,研究人員還捕獲了單個分子上的大部分基因組。通過數(shù)據(jù)分析,他們確定了42個具有可預(yù)測的5-甲基胞嘧啶修飾的位點,這些位點在亞基因組長度的mRNA之間呈現(xiàn)一致的位置。在其他陽性單鏈病毒中,RNA甲基化在感染過程中會發(fā)生動態(tài)變化,影響宿主—病原體相互作用和病毒復(fù)制。一旦數(shù)據(jù)集可用于新型冠狀病毒的直接RNA序列,研究人員可能會發(fā)現(xiàn)其他的修飾,而人們目前對冠狀病毒的表觀轉(zhuǎn)錄組修飾知之甚少。綜上所述,研究人員認(rèn)為,通過使用直接的RNA序列數(shù)據(jù),有助于對新型冠狀病毒分子生物學(xué)的深入了解,并可能幫助構(gòu)建病毒亞基因組長度mRNA結(jié)構(gòu)的詳細(xì)視圖[3]。

3. COVID-19藥物學(xué)研究進(jìn)展 

■ 由國家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心和深圳市第三人民醫(yī)院劉磊、劉映霞團(tuán)隊合作完成的一項“法匹拉韋治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)患者的安全性和有效性的臨床研究”已得出初步臨床結(jié)果(注冊號:ChiCTR2000029600)。研究顯示法匹拉韋(Favipiravir)可能通過加快病毒清除,達(dá)到緩解新型冠狀病毒肺炎進(jìn)展的療效,目前研究結(jié)果已投稿至中國工程院院刊。本項臨床試驗共入組80例患者,法匹拉韋治療組35例,對照組是年齡、性別和疾病嚴(yán)重程度與治療組相匹配的45例新冠肺炎患者,接受洛匹那韋/利托那韋片治療。比較兩組的用藥到病毒清除時間的中位數(shù)、療程第14天胸部影像學(xué)改善率及安全性。研究結(jié)果顯示,病毒清除方面,法匹拉韋試驗組治療后患者病毒清除(病毒核酸轉(zhuǎn)陰)時間中位值顯著短于對照組,分別為4天和11天。而在另一關(guān)鍵指標(biāo),患者胸部影像學(xué)改善方面,治療組與對照組相比,改善率分別為91.43%和62.22%。同時,與對照組相比,法匹拉韋治療組的不良反應(yīng)少,耐受性更好。兩組患者的所有基線特征均具有可比性。

4. COVID-19流行病學(xué)研究 

■ 2020年3月12日,武漢大學(xué)藍(lán)柯、劉映樂,華中科技大學(xué)孫自鏞及復(fù)旦大學(xué)余宏杰共同通訊在國際頂級醫(yī)學(xué)期刊NEJM在線發(fā)表題為“Detection of Covid-19 in Children in Early January 2020 in Wuhan, China”的研究論文,該研究對2020年1月7日至1月15日,共366名住院兒童(≤16歲)進(jìn)行了回顧性研究。在366名兒童中,最常見的病原體是甲型流感病毒(占23例[6.3%])和乙型流感病毒(占20例[5.5%])。在6例患者中(1.6%)檢測到了導(dǎo)致Covid-19的病毒新型冠狀病毒。該研究從Covid-19患者的父母或監(jiān)護(hù)人那里獲得了知情同意,以公布其臨床數(shù)據(jù)。6名Covid-19患者的發(fā)病日期在2020年1月2日至1月8日之間,并且患者在1月7日至1月13日之間住院。這項研究結(jié)果顯示,在新型冠狀病毒暴發(fā)的早期,Covid-19發(fā)生在這些患者兒童中,會引起中度至重度呼吸系統(tǒng)疾病,且與一名患者的ICU入院有關(guān),而患者兒童或家屬均沒有直接接觸過華南海鮮批發(fā)市場或彼此直接接觸過[4]。

■ 2020年3月12日,新加坡國家傳染病中心Oon-Tek Ng等人在國際頂級醫(yī)學(xué)期刊NEJM在線發(fā)表題為“SARS-CoV-2 Infection among Travelers Returning from Wuhan, China”的研究論文,該研究追蹤了2020年1月30日登上從武漢到新加坡航班的94人。

在登機(jī)時和登機(jī)前進(jìn)行的體溫檢查,阻止了3例高熱人士登機(jī)。抵達(dá)新加坡后,對乘客進(jìn)行了一次體溫檢查(發(fā)燒定義為體溫≥38°C),發(fā)現(xiàn)2人(一名48歲的女性[患者1]和一名47歲的女性[患者2])發(fā)燒了。2名發(fā)熱婦女立即被送往醫(yī)院,她們的新型冠狀病毒的檢測結(jié)果呈陽性。其余的92名發(fā)熱旅客(年齡在2至82歲之間)在政府檢疫機(jī)構(gòu)隔離了14天,在那里他們每天進(jìn)行三次癥狀和發(fā)燒檢查。有六名患者報告了癥狀,所有6個人的新型冠狀病毒測試均為陰性。在檢疫第3天,從86名無癥狀者中的76名(75支鼻咽拭子樣本和1支鼻拭子樣本)中獲取了樣本,并通過PCR分析進(jìn)行了測試。一個17歲的男孩(患者1的兒子)檢測到Covid-19呈陽性,并在2周內(nèi)繼續(xù)呈PCR陽性狀態(tài),而一個41歲的男人沒有定論(N基因和ORF1ab基因陰性)。在檢疫第6天,從所有87名被隔離的無癥狀人員中抽取了樣本(85例鼻咽拭子樣本和2例鼻拭子樣本,經(jīng)過測試均為陰性)。第14天,所有未在醫(yī)院隔離的人都被隔離檢疫,所有患者均未感染Covid-19。從無癥狀或癥狀輕微的Covid-19病例中了解新型冠狀病毒感染的傳播意義對于制定圍堵策略至關(guān)重要[5]。

 

參考文獻(xiàn):

[1] W. Wang, Y. Xu, R. Gao, et al. Detection of SARS-CoV-2 in Different Types

of Clinical Specimens. JAMA 2020.

[2] Xia, N.; Wang, G.; Gong, W. Serological Test is an Efficient Supplement of RNA Detection for Confirmation of SARS-CoV-2 Infection. Preprints 2020, 2020030184.

[3] Taiaroa G, Rawlinson D, Featherstone L, et al. Direct RNA sequencing and early evolution of SARS-CoV-2. bioRxiv 2020:2020.03.05.976167.

[4] Liu W, Zhang Q, Chen J, et al. Detection of Covid-19 in Children in Early January 2020 in Wuhan, China. New England Journal of Medicine 2020.

[5] Ng O-T, Marimuthu K, Chia P-Y, et al. SARS-CoV-2 Infection among Travelers Returning from Wuhan, China. New England Journal of Medicine 2020.

 

供稿 | 坪山生物醫(yī)藥研發(fā)轉(zhuǎn)化中心、科研部

來源 | 人民日報、轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)、iNature、科學(xué)網(wǎng)、環(huán)球科學(xué)

編輯 | 鮑啦